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医学分子生物学国家重点实验室 二零二二年第一次青年沙龙会议
作者: 时间:2022-01-26 微信分享:
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会议时间:
2022年1月21日(周五)中午12:00 -13:30
会议地点:基础所可胜大楼外宾室
参加人员:1.重点室年龄在45岁以下的在职青年研究岗位人员。
                2.非重点室的其他所内研究人员。
                3.希望参与交流合作的医院医生 
                4.对会议主题感兴趣的青年在研学生。
                5. 重点室办公室全体人员及会议组织服务人员。
讲者:王琳 研究员
报告题目: Mass spectrometry based metabolomics & spatially-resolved metabolomic activity

此次青年沙龙王琳老师为我们介绍了基于质谱的代谢组学和空间分辨代谢组学。

 首先,王琳老师给我们介绍了一个峰值注释和验证引擎—PAVE,用于注释非靶标代谢组学数据。 PAVE通过整合正向模式、负向模式和标记数据的算法,测量每个峰值对弱源碰撞诱导解离的反应,并结合数据库的搜索,注释到了大约2000个表观代谢物。PAVE能够对LC-MS代谢组学数据进行系统的注释,可支持只包含几千个可检测的代谢物的普通微生物的代谢组学数据的分析

 接着,王琳老师提出了一个全局网络优化方法,即NetID,用于注释非靶标的LC-MS代谢组学数据。将这种方法应用于酵母和小鼠的代谢组学数据,发现了一组与硫胺(维生素B1)有关的代谢物,专门在肾脏中积累。因此,NetID应用现有的代谢组学知识和全局优化,大幅提高非目标代谢组学数据集的注释覆盖率和准确性,可用于发现新的诊断标志物。

 最后,王琳老师介绍了可以定量确定代谢活动的区域差异的 iso-MS,即将稳定的同位素标记的营养液输注与质谱成像(iso-MSI)结合起来,以空间分辨率的方式对哺乳动物组织的代谢活动进行可视化和定量。王琳老师和她的团队成员们利用iso-MSI,确定了肾脏不同区域TCA循环的主要碳源 ,同时也为评估大脑中的代谢异质性提供了关键的临床信息,这项技术对器官的代谢活动进行了更广泛和更高的空间分辨率分析,在疾病生物学方面的应用将会越来越多。



 展示末尾,在座的各位老师和同学气氛热烈,积极踊跃,不断提出有意义的问题和见解。


医学分子生物学国家重点实验室

2022年01月21日